гамма штамм коронавируса что это значит
«Гамма» — очередная буква ковид-алфавита. Новый штамм коронавируса дошел до России
Лента новостей
Все новости »
Речь идет о бразильском варианте возбудителя. Ученые пока склоняются к тому, что он, вероятно, является более заразным и опасным, чем предшественники. Требуется ли принимать дополнительные меры в связи с появлением этой мутации?
В России впервые выявлен «гамма»-вариант коронавируса. Об этом в четверг, 22 июля, сообщили «Интерфаксу» в научном центре Роспотребнадзора «Вектор». Так называемый бразильский штамм может быть более заразен, чем оригинальный коронавирус, и более опасен для заболевших, чем вариант «дельта».
В конце весны один из работников на золотом прииске в лесах Французской Гвианы почувствовал недомогание. Вскоре у него и у нескольких десятков его сослуживцев подтвердился ковид — причем именно вариант «гамма». Этот случай был описан в научной работе, опубликованной в журнале Emerging Infectious Diseases американского регулятора CDC, поскольку существенная часть заболевших была вакцинирована — и не китайской Sinovac, а любимицей западной фармацевтики американо-немецкой Pfizer. Более того, заболеваемость среди привитых и непривитых различалась совсем незначительно — заболели 60% вакцинированных работников и 75% невакцинированных.
Это может указывать на способность «гамма»-варианта, который теперь присутствует и в России, к преодолению поствакцинного иммунитета. Хотя авторы работы и делают оговорку, что шахтеры жили в тесных помещениях и работали в условиях высокой влажности, а качество их вакцинации никто не контролировал. Насколько опасен может быть вариант «гамма» в действительности? Рассуждает вирусолог Павел Волчков:
Павел Волчков вирусолог «Нужно понимать, что «гамма» и «дельта» достаточно сильно отличаются. И иммунитет, который вы получаете к «бете» или к «дельте», будет наиболее эффективен к соответствующему же вирусу. По отношению к другому вирусу из соседней ветки — эффективность иммунного ответа будет ниже процентов на 5-10 в текущем формате, может быть, на 15. Что касается первичных инфекций — не думаю, что ветвь «гамма» будет более контагиозна, чем «дельта». Однако мы сейчас в режиме реального времени сможем увидеть: если «гамма» сможет как-то существенно увеличить свою долю присутствия в России, то это значит, что у нее есть потенциал к эффективному размножению».
Данные о заразности «гамма»-варианта можно назвать противоречивыми. Мутация появилась почти одновременно с «дельтой», которая теперь доминирует во многих странах мира, в том числе и в России, а «гамма» представлена гораздо меньше. При этом в отдельных регионах ситуация обратная — например, в Люксембурге и американском штате Иллинойс доминирует теперь именно бразильский штамм, несмотря на конкуренцию со стороны «дельты».
Есть также причины считать или хотя бы подозревать, что «гамма» может быть опаснее для заболевших. Как сообщили в начале июля в Депздраве штата Вашингтон, среди больных с «гаммой» чаще требуется госпитализация, которая чаще заканчивается летальным исходом. Требуется ли принимать дополнительные меры в связи с появлением этой мутации в России? Комментирует старший научный сотрудник Института проблем передачи информации РАН Александр Панчин:
Пока вариант «гамма» наиболее представлен в Северной и Южной Америке, однако десятки случаев зафиксированы практически в каждой из стран Евросоюза. О взрывном росте заболеваемости «гаммой», по аналогии с весенней волной «дельты», пока говорить не приходится. Однако с учетом повышенной заразности новых вариантов вируса ковид продолжит распространяться и мутировать, порождая все более опасные линии инфекции, пока практически все население Земли не будет вакцинировано.
В РАН рассказали об особенностях «гамма»-штамма COVID-19
Академик РАМН, научный руководитель ГУ НИИ вакцин и сывороток им. Мечникова Виталий Зверев прокомментировал сообщение научного центра «Вектор» о том, что в России выявлен «гамма»-штамм COVID-19. Об этом он рассказал в интервью «Ленте.ру».
По его словам, он менее опасен, чем индийская разновидность коронавирусной инфекции.
«Обнаружение «гамма»-штамма не значит, что он вытеснит циркулирующие в России разновидности COVID-19», — сказал эксперт.
Зверев также отметил, что «гамма»-штамм коронавируса отличается от остальных разновидностей тем, что у него есть несколько мутаций на участке, связанном с рецепторами. Наиболее близким к нему по строению является британский штамм COVID-19.
«Там всего две серьезных мутации, но они менее опасны, чем в том же «дельта», то есть индийском штамме. То есть они не сильно должны менять свойства вируса. Если вакцины работали против обычного коронавируса, то они должны работать и против этого штамма. По идее ничего такого нового он не должен принести ни в клинику, ни в диагностику, ни в лечение, ни в профилактику», — подчеркнул академик.
Кроме того, специалист отметил, что паниковать из-за обнаружения данного штамма коронавируса не нужно.
«Вот у нас все говорят про индийский штамм, но его в Индии было зафиксировано всего 10 процентов от общего числа заболевших, это по данным трехнедельной давности. Отдельные случаи есть, но это не значит, что он сейчас заместит те штаммы, которые циркулируют у нас в стране», — добавил ученый.
Ранее в научном центре «Вектор» сообщили, что бразильский штамм коронавирусной инфекции «гамма» выявлен на территории России, он, как и индийский штамм «дельта», является более заразным.
В начале лета ученые сообщили об опасности «индийского штамма» SARS-CoV-2 — «дельта», в том числе для привитых: у этого вида вируса есть две основные мутации в рецепторосвязывающем домене, которые в два-три раза снижают иммунную защиту у вакцинированных и переболевших.
Новый опасный гамма-штамм коронавируса обнаружен в России
Штамм коронавируса «гамма» выявили в России, он наряду с «дельтой» вызывает озабоченность из-за повышенной заразности. Что это за разновидность вируса и чем она опасна?
Дельта-штамм коронавируса в России могут вытеснить новые, более патогенные мутации, заявили 22 июля в центре «Вектор».
Штаммы «лямбда» и «эпсилон», «относимые к вариантам, вызывающим интерес», на территории РФ не были обнаружены, уточнили в «Векторе».
Там также рассказали, что в России изучаются образцы еще нескольких «мутантов» вируса, выявленных в Австралии, Таиланде и Италии. Это может занять около двух месяцев. Исследователи оценивают жизнеспособность новых штаммов, их патогенность (это определяется на лабораторных животных) и другие свойства вируса.
Читайте также
Ранее ученый-генетик Дмитрий Прусс рассказал, что бразильский штамм «гамма» — очень «крутой» и вполне может помериться силами и британской «альфой». Больше всего пока «гамма» распространен в США.
Есть и еще один штамм, вызывающий тревогу — «лямбда», который начал распространяться с 2020 года из Перу. Он выявлен в июне в Европе. Этот вариант вируса имеет не менее семи значительных мутаций в шиповом белке (у «дельты» — три). Они могут повысить заразность вируса и сделать его более устойчивым перед антителами — как выработанными естественным путем после заражения у переболевших, так и после вакцины. По мнению российского иммунолога Владислава Жемчугова, «лямбда» может стать самой «злой» из всех выявленных мутаций SARS-CoV-2
«Вектор» назвал единственный регион со штаммом коронавируса «гамма»
Единственный регион России, в котором выявили штамм коронавируса «гамма» (бразильский), — это Якутия, его быстрое распространение стране не угрожает, рассказал генеральный директор центра «Вектор» (разработчик вакцины «ЭпиВакКорона») Ринат Максютов, передает корреспондент РБК.
«Бразильский вариант коронавируса получен, проходит в настоящее время свои исследования. Встречается вариант «гамма» сегодня только в одном субъекте России, дальнейшего распространения он не получил», — рассказал ученый.
Шансов у «гаммы» на быстрое распространение нет, потому что его вытесняет индийский штамм, или штамм «дельта», пояснил Максютов. По его словам, этот вариант SARS-CoV-2 «в подавляющем большинстве регионов заполонил все разнообразие коронавируса в России».
В реестр ВОЗ для дальнейшего мониторинга (Alerts for Further Monitoring) включено 16 распространенных штаммов коронавируса, хотя число различных мутаций вируса насчитывает как минимум несколько тысяч. В списке вариантов вируса, представляющих опасность (VOC) — альфа-, бета-, гамма- и дельта-варианты. Это мутации коронавируса, обнаруженные в Великобритании, ЮАР, Бразилии и Индии.
Сейчас ВОЗ считает доминирующим в мире дельта-вариант коронавируса (индийский штамм). По оценкам специалистов, на него приходится до 80% всех новых заражений. Ученые утверждают, что дельта-вариант как минимум на 50–60% заразнее оригинального уханьского штамма.
О возникновении бразильского штамма коронавируса стало известно в декабре 2020 года. Исследователи из университетов Оксфорда, Сан-Паулу и Имперского колледжа Лондона выявили, что этот штамм потенциально способен преодолевать иммунитет, выработанный у ранее переболевших COVID-19 людей, так как в 1,4–2,2 раза более заразен, чем другие варианты коронавируса.
В России бразильский штамм («гамма») обнаружили 22 июля, об этом сообщил научный центр «Вектор». Там, однако, уточнили, что выявили единичные случаи распространения этого варианта в стране. Заразившиеся этим штаммом россияне не были привиты от COVID-19, подчеркивали в «Векторе». Центр подтвердил, что как бразильский» так и индийский штаммы более заразны по сравнению с оригинальным вариантом и могут снижать эффективность антител.
Пять новых штаммов коронавируса: чем опасны и чего от них ждать?
Гид по новым вариантам (штаммам) вируса, вызывающего COVID-19 и генетическим изменениям, которые могут сделать его более контагиозным и неуловимым для иммунной системы.
Когда прошлой зимой коронавирус SARS-CoV-2 ворвался в мир, ученым стало ясно, что дело плохо, но они посчитали, что вирус, по крайней мере, стабилен. Коронавирусы не мутируют так быстро, как, например, вирусы гриппа, гепатита или ВИЧ, — отчасти благодаря системе молекулярного редактирования, которую SARS-CoV-2 и родственные ему вирусы используют для предотвращения злокачественных генетических ошибок при репликации.
Но ученые были правы лишь наполовину. Вирус и правда не принес ничего хорошего — но оказалось, что и стабильностью он не отличается. С тех пор, как SARS-CoV-2 «перепрыгнул» с животных на людей, он накапливал незначительные случайные мутации: как однобуквенные «опечатки» в генетической последовательности вируса, так и вставки или выпадение более длинных фрагментов вирусной РНК. Большинство мутаций либо убивают вирус, либо никак не меняют его строение и поведение.
Но недавно было обнаружено несколько новых штаммов оригинального вируса (его также называют «вирусом дикого типа»), мутации которых, похоже, сильно влияют на его свойства, в том числе на контагиозность. Эти штаммы были обнаружены один за другим в разных географических регионах (Великобритания, ЮАР, Бразилия) и в некоторых случаях стали доминировать над штаммами, распространенными в этих регионах ранее. Одновременное появление сразу нескольких штаммов в поле зрения ученых частично объясняется улучшением технологий мониторинга случаев заражения и увеличением объемов секвенирования вирусов. Однако схожесть паттернов мутаций в новых штаммах может указывать на то, что эти изменения не случайны.
«Мы видим, как похожие мутации появляются в разных местах, — говорит Адам Лоринг, вирусолог из Мичиганского университета. — Это наводит на размышления о том, что они для чего-то нужны».
Пока что известно, что эти мутации помогают вирусу легче передаваться от человека к человеку и оставаться незамеченным иммунной системой. В январе ученые впервые сообщили, что антитела людей, переболевших COVID-19, не полностью нейтрализуют штамм вируса, обнаруженный в ЮАР. Кроме того, похоже, несколько человек, перенесших COVID-19, повторно заразились мутантным штаммом.
По последним данным, вакцины, производимые компаниями Moderna и Pfizer, скорее всего, защищают и от новых штаммов коронавируса. Разработчики «Спутника V» также заявили о его эффективности против мутировавшего вируса. Эффективность вакцин этих производителей превышает 90 %, поэтому, по мнению экспертов, даже при небольшом снижении этой цифры их все равно стоит использовать.
«Я рад, что это не лишает смысла [использование вакцин от COVID-19], но, очевидно, требует пристального внимания», — говорит Лоринг. Он добавляет, что на протяжении следующих лет компаниям, возможно, придется изменить эти вакцины и начать вводить пациентам новые их версии — подобно тому, как каждый год меняют вакцины от гриппа. Большинство вакцин вызывают намного более сильный иммунный ответ, чем естественное заражение вирусом. Во время клинических испытаний своей вакцины компания Moderna показала, что антитела, вырабатываемые после вакцинации, остаются в организме дольше, чем антитела, вырабатываемые при естественном заражении SARS-CoV-2.
по теме
Эпидемия
Вакцины, антитела, антигены. Гид по иммунологии для чайников
Ниже перечислены пять наиболее значимых штаммов коронавируса в порядке обнаружения учеными. В списке указано место первого выявления каждого из них и официальные названия штаммов или обозначения, используемые исследователями. (Разные группы исследователей используют разные способы обозначения штаммов, что вызвало путаницу. В этом списке использованы наименования, основанные на филогенетическом происхождении штаммов, но некоторые варианты вируса все равно имеют больше одного названия). Также здесь приведены важные мутации каждого штамма (названия мутаций состоят из букв и цифр, обозначающих позицию мутации в геноме вируса) и известная информация о том, что эти мутации делают.
Испания
Штамм 20A.EU1, впервые выделенный в Испании, содержит мутацию A222V в последовательности белка шипа. Шип — структура вируса SARS-CoV-2, которая связывается с рецепторами клеток ACE2 человека, помогая вирусу проникать внутрь этих клеток при заражении. Кроме того, именно с шипами связываются антитела человека, вырабатываемые для иммунного ответа на инфекцию. Лабораторные исследования показали, что человеческие антитела немного менее эффективно нейтрализуют вирусы с мутацией A222V. За несколько месяцев штамм 20A.EU1 стал доминирующим в Европе. Тем не менее эпидемиологи не наблюдали доказательств того, что этот штамм быстрее передается от человека к человеку, чем оригинальный вирус. Исследователи считают, что штамм, который на тот момент доминировал в Испании, распространился по всему континенту, когда в Европе начали ослаблять ограничения на перемещение.
Великобритания
Британские ученые наблюдали за штаммом B.1.1.7 некоторое время, прежде чем объявили в декабре, что он может передаваться как минимум на 50 % активнее, чем вирус дикого типа. Это заявление было основано на эпидемиологических данных, указывающих, что вирус нового штамма быстро распространяется среди населения, и привело к запретам на пересечение границ и усилению карантинных мер в Великобритании.
Штамм B.1.1.7 содержит 17 мутаций, некоторые из них затрагивают белок шипа. Было обнаружено, что одна из этих мутаций, N501Y, помогает вирусу прочнее связываться с рецепторами клеток ACE2. Однако пока неясно, обусловлена ли повышенная контагиозность данного штамма только этой мутацией или еще какими-либо изменениями структуры шипа.
Несмотря на первоначальное беспокойство, не было найдено подтверждений тому, что этот штамм более заразен для детей в сравнении с оригинальным, говорит Шерон Пикок, исполнительный директор Консорциума Великобритании по геномике COVID-19 (COG-UK), группы, анализирующей генетические изменения вируса. И Pfizer, и Moderna считают, что их вакцины от COVID-19 будут работать и против штамма B.1.1.7. Недавние данные из Великобритании указывают на то, что новый штамм может быть более летален по сравнению с диким типом, но это пока только предварительные результаты.
Штамм B.1.1.7 выделяется на фоне других, потому что он накопил так много мутаций. Лоринг и другие исследователи полагают, что эти мутации могли возникнуть при длительном заражении одного пациента с ослабленным иммунитетом, из-за чего организм пациента не мог побороть вирус. По словам Скотта Вивера, микробиолога из медицинского подразделения Техасского университета в Галвестоне, возможно, только некоторые из этих генетических изменений дали штамму эволюционное преимущество и позволили ему быстро распространиться по Великобритании. Остальные мутации просто остались в геноме за компанию.
Штамм B.1.351 появился в поле зрения ученых примерно в то же время, что и британский B.1.1.7. B.1.351 быстро распространился и стал доминантным вариантом вируса в ЮАР. Как и европейский штамм, B.1.351 содержит мутацию N501Y, хотя данные указывают, что два этих штамма возникли независимо друг от друга. Но ученых больше беспокоит другая мутация в африканском штамме, обозначаемая E484K. Это изменение в геноме, возможно, помогает вирусу избегать иммунного ответа и действия вакцин.
Эволюционный биолог и биоинформатик из Онкологического исследовательского центра Фреда Хатчинсона в Сиэтле Джесс Блум с командой с помощью клеток дрожжей создали серию вирусных белков-шипов, содержащих практически все из более 3800 возможных изменений в структуре, которые могут быть вызваны генетическими мутациями. Затем исследователи протестировали, насколько хорошо антитела связывались с каждым из этих видоизмененных шипов. Они обнаружили, что в результате мутации E484K и других похожих мутаций в этом конкретном участке белка антитела некоторых людей в 10 раз хуже связывались с шипами коронавируса. Команда Блума также показала, что некоторые коктейли из антител (подобные коктейли в настоящий момент тестируют фармацевтические и биотехнологические компании Regeneron и Eli Lilly) могут быть менее эффективными при наличии мутаций, которые имеются в штамме B.1.351.
В конце января ученые из ЮАР опубликовали препринт (научная статья, которая еще не прошла независимую рецензию), в котором показали, что сыворотка крови пациентов с COVID-19, содержащая антитела, значительно менее эффективно могла нейтрализовать новый штамм. В другом препринте, опубликованном 26 января, ученые сообщают, что они добавили вирус B.1.351 в сыворотку крови, взятую у людей, которым ранее ввели вакцину производства Pfizer или Moderna. В результате антитела в такой сыворотке проявляли сниженную нейтрализующую активность по отношению к мутантному вирусу в сравнении с вирусом дикого типа.
Однако антитела в пробирке — не то же самое, что вакцина в организме живого человека. В результате применения любой из упомянутых вакцин организм производит столько антител, что даже при сниженной активности их может быть достаточно для нейтрализации вируса. Вакцины также запускают работу других защитных механизмов иммунной системы. Тем не менее Moderna начала разработку бустерной вакцины, специфичной по отношению к новым штаммам.
Бразилия
В январе ученые сообщили об обнаружении двух новых вариантов коронавируса в Бразилии, происходящих от общего предка. Но хотя у этих двух штаммов есть общие мутации с вариантами, обнаруженными в других регионах, по всей вероятности, они возникли независимо.
Из этих двух штаммов ученых больше беспокоит P.1. Он содержит больше мутаций, чем Р.2 (хотя оба штамма имеют мутацию E484K), и уже был обнаружен в Японии и других странах. Возможно, Р.1 накопил свои мутации в организме пациента с ослабленным иммунитетом. Но генетик Эмма Ходкрофт из Бернского университета в Швейцарии говорит, что в этом случае может быть сложнее определить точное время и место возникновения штамма, поскольку в Бразилии секвенируют гораздо меньше образцов вируса, чем в Великобритании.
Ходкрофт отмечает, что в 2020 году и в Бразилии, и в ЮАР были крупные вспышки COVID-19. При таком большом количестве зараженных людей, вырабатывающих антитела к вирусу, штамм, способный избегать распознавания иммунной системой и повторно заражать уже переболевших людей, мог иметь значительное преимущество и широко распространиться в популяции.
Распространение и изменение вирусов
Хотя кажущееся внезапным появление нескольких вариантов белка шипа является причиной для беспокойства, по словам исследователей, пока нет доказательств, что коронавирус претерпел какие-либо принципиальные изменения, позволяющие ему мутировать быстрее. По мнению Лоринга, более вероятно, что большое число заражений COVID-19 по всему миру предоставляет вирусу множество возможностей для постепенных небольших изменений. Каждый зараженный человек — это, по сути, дополнительный шанс для возникновения нового штамма SARS-CoV-2. «Это имеет отношение к эволюции, но в первую очередь — это вопрос эпидемиологии», — говорит Лоринг. В целом «вирус совершенствуется в своей роли».